在遥远的未来，人类发明了一种先进的科技——“水晶芯片”，它可以将生物的意识和记忆存储并转移至另一种生命体中。这样，当一个晶码战士（拥有水晶芯片的人类）牺牲后，他的灵魂可以转移到另一具人体内继续战斗。剧情开始时，地球面临一场前所未有的危机：来自外太空的黑暗势力“暗影军团”正试图利用人类的能源，污染和破坏整个宇宙中的星球。为了对抗敌人，四位性格迥异但拥有共同目标的年轻人——赛斯、露娜、艾瑞克与莉莎被选中成为晶码战士，并分别获得了各自的晶码兽伙伴。赛斯是勇敢的战士，他可以召唤出强大的能量武器来打击敌人；露娜是一位智慧型晶码战士，擅长使用各种高科技设备进行侦察和信息收集；艾瑞克则是个机械师，能够修理任何受损的装备甚至自己制造新奇装置；而莉莎则是治疗者，在战斗中为队友提供恢复魔法。四人组成了一个紧密团队，并在旅途中不断成长与磨合。为了保护地球、阻止黑暗势力侵占宇宙，他们必须面对重重挑战和考验，在这个过程中逐渐揭开关于水晶芯片的秘密以及人类命运的真相。在这个充满奇幻色彩的世界里，晶码战士们将如何利用各自的特长战胜敌人？他们之间又会发生怎样的情感纠葛呢？一切谜底都等待着观众一起揭晓。
