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故事发生在1924年的圣瓦尔贵族子弟寄宿学校——玛格丽特学院。转学生久城一弥（江口拓也配音）刚来到这里时，由于他那深邃的眼眸和黑色的长发，被同学们戏称为“不详的黑色死神”。然而，一弥实际上是一个诚实而略显木讷的学生，这种性格让他总是不经意间卷入那些难以用常理解释的怪奇事件中。一次偶然的机会，在一起凶案现场，他遇到了身材娇小、一头金色长发的女孩维多利加（悠木碧配音）。这位谜一般的少女凭借其高超的推理能力帮助一弥化险为夷，并从此成为了他的朋友。在玛格丽特学院里，流传着许多关于灵异事件的故事。这些故事背后隐藏的秘密和真相，需要一弥和维多利加共同揭开。随着调查的深入，一弥和维多利加将经历一场又一场扑朔迷离的冒险，解开一个又一个谜团，逐渐揭开这所学校背后的秘密。而他们的友谊也在这一过程中愈发坚固，两人联手破解一个个难以置信的案件，成为了校园里的一段佳话。
