1994年的《美少女战士》第三季讲述了小兔她们升入初三后的生活。为了备战高中入学考试，战士们组成了一个读书会，并在小丽家中温习功课。小丽做了一个怪梦，梦见救世主出现，世界毁灭，这让她非常担忧。新的敌人死亡变种开始利用心魔寻找拥有“纯真之心”的人。当心魔袭击小丽时，其他战士虽然尝试救援但不敌敌人。突然，两位神秘的新战士水手天王星和水手海王星现身，并消灭了心魔，她们的目标是找到心能水晶。与此同时，小兔和小卫的爱情也有了新的进展，小兔获得更强的力量对抗新敌人。在一次偶然的机会下，小兔、小遥和小满结识了两位读无限学园高一的新朋友——天才赛车手天王遥和优雅的小提琴家海王满。随着故事的发展，小兔的生日来临，她希望能得到一双玻璃鞋作为礼物，但小卫却因疏忽而迟到了。在救小卫的过程中，心魔再次出现，企图夺取小兔的纯真之心，最终被水手天王星和水手海王星联手击败。为了证明自己也拥有纯真之心，美奈子开始频繁献血以吸引心魔注意，但此举让战士们十分担忧。在一次战斗中，美奈子意外唤醒了毁灭战士水手土星的力量，她成为了女主人9，对抗战士们的任务变成了寻找真正的救世主。随着故事推进，大家逐渐发现无限学园可能是死亡变种的大本营，一场关乎生死的终极对决即将展开……
