《校园迷糊大王》的故事发生在一个名为矢神高中的校园内，主人公冢本天满（由小清水亚美配音）是一个性格单纯、充满活力的高中生。她的心中有着一个名叫乌丸大路（由小西辽生配音）的暗恋对象，尽管这使她的日常生活偶尔显得有些波折，但总体上还是充满了欢笑和快乐。乌丸大路拥有一头标志性的西瓜发型，他不仅成绩优秀、运动全能，还隐藏着自己的秘密。更让人意想不到的是，这位看似完美的少年竟身患绝症，他的生命即将走到尽头。与此同时，外表粗犷的播磨拳儿（由高桥广树配音），内心却藏着一颗温柔的心，而这个女孩的名字叫做天满。虽然天满对播磨有着特殊的情感，但她那天然呆的性格并未让她意识到这一点。当播磨鼓起勇气向天满表达爱意时，迎接他的不是他期待中的回应，而是性格直爽的学院偶像泽近爱理（由堀江由衣配音）。面对如此坦率且充满热情的表白，泽近爱理的心中也悄然萌生了不一样的情感。在矢神高中的校园里，天真的爱情故事每天都在上演，迷糊而快乐的生活构成了这个美好青春的篇章。
