在公元2133年，人类社会已经陷入一片荒芜与混乱之中。曾经的核武器让地球失去了往日的面貌，仅存的人类为了生存建立了名为奥林帕斯的新城。在这里，先进的生化人成为人类忠实的服务者和守护者，而ESWAT特种部队则肩负着维护世界和平的任务。布里艾诺斯（山寺宏一 配音）是一名勇敢的ESWAT成员，在一次执行任务中为了保护女友迪娜•纳兹（小林爱 配音），不幸身受重伤。奥林帕斯高层决定利用布里艾诺斯的基因创造了一个更为强大的生化人特雷斯，将其与迪娜组成新的搭档。尽管起初两人都有所抵触，但在日复一日的合作中，他们之间的关系逐渐升温。然而，好景不长，各地接连发生机器人失控事件，这些机器人的攻击目标竟然指向了世界最大重工业生产国波塞冬。与此同时，奥林帕斯内部也出现了被改造的半机械人开始失去控制的情况。面对这前所未有的危机，迪娜不得不做出艰难的选择，是继续与特雷斯并肩作战，还是寻找另一种解决之道。这部《苹果核战记2》将带你进入一个充满高科技与人性考验的世界，在这里，每一步选择都将影响着人类的未来命运。
