《端脑动画版》的故事发生在一个充满谜团和挑战的校园之中。校内推理社拍摄的一部微电影剧情突然变成了现实。微电影的女主角、夏驰的女友晴知在收到一封神秘来信后，神秘失踪。更加诡异的是，除了夏驰和他的好友孟秦之外，几乎所有人都忘记了晴知的存在，仿佛她从未在这个世界出现过。为了寻找晴知，两人被迫解开信中隐藏的谜题。他们意外地发现，晴知被带入了一个名为“端脑”的游戏之中。进入游戏后，他们必须面对一系列智力、情商、体力甚至是精神力上的考验。在这场智力与智慧的较量中，夏驰和孟秦逐渐揭开了一系列令人震惊的秘密。然而，随着谜题的不断解开，他们也渐渐意识到，“端脑”游戏中隐藏着更为深邃的真相——这不仅仅是一个关于爱情的游戏，更是一场关乎整个世界的冒险。通过层层挑战，他们不仅寻找到了晴知，还揭开了“端脑”背后的秘密，最终成功拯救了晴知，也为自己赢得了前所未有的成长和勇气。
