延续前一集的故事线，《马达加斯加2：逃往非洲》中，狮子亚历克斯（本·斯蒂勒 配音）、斑马马蒂（克里斯·洛克 配音）、长颈鹿迈尔曼（大卫·休默 配音）和河马格洛里亚（贾达·萍克·史密斯 配音），以及可爱的企鹅们，历经千辛万苦终于改造了一架失事的飞机并成功起飞。正当大家欢庆回归纽约之际，意外降落到了非洲大草原上。亚历克斯终于在非洲见到了自己的父母，但这父子俩的生活习性和言行举止天差地别，使得这群来自纽约中央公园的动物明星们，在这个全新的环境中显得格格不入。面对这突如其来的困境，这群失意的动物园明星开始尝试融入这片未知的土地和它的居民。亚历克斯努力展现自己雄狮的一面，但非洲的大草原上的狮子却对它充满戒备；马蒂通过模仿当地斑马的行为举止，企图赢得非洲斑马的认可；迈尔曼则试图用长颈鹿的方式与当地的动物沟通；而格洛里亚则不断尝试着和非洲的河马建立联系。在这个全新的环境中，这些纽约来的动物明星们必须学会如何适应新的环境，并克服各种困难，才能真正地融入这个充满挑战的新世界。
